El CAFUNE se rige en su actividad por los siguientes principios:

• Reconoce y orienta sus actividades en función a los diversos sectores de la sociedad.
  
• Contribución activa y crítica a la transformación de la estructura económica, social y educativa del país.
  
• Solidaridad con los sectores populares.
  
• Rechazo a toda forma de alienación, violencia, intolerancia, discriminación y dependencia.
  
• El Centralismo Democrático se ejerce de la siguiente manera:
  

  		Partir de la crítica y autocrítica como métodos de análisis y discusión.
  		Las decisiones y autoridad surgen de las bases, la minoría se somete a la mayoría; y
  		Una permanente relación recíproca entre sus bases y directivos.

  
  
• Autonomía orgánica, económica y administrativa, entendiéndose por ello elaborar y aprobar su estatuto, reglamento y demás normas, gobernarse de acuerdo a ellos, organizar y planificar sus actividades; y administrar sus bienes y recursos económicos.
  
• Rechazar todo tipo de proselitismo político-partidario o lucrativo.